Если ключи на токене были созданы разрешенными для экспорта (их можно скопировать кнопкой «Скопировать контейнер»), то перенести на айпад можно. Для этого нужно на машине с windows/unix экспортировать ключ в блоб, передать блоб на айпад и там импортировать из блоба в контейнер.
У нас в SDK есть похожие примеры:
http://cpdn.cryptopro.ru/content/csp36/html/group___acquire_example_ExportingCertificateExample.html [2]
http://cpdn.cryptopro.ru/content/csp36/html/group___acquire_example_ExportingSessionKeyExample.html [3]
Если ключи на токене были созданы запрещенными для экспорта, то средствами API их нельзя никуда скопировать. Чтобы это проверить, можно попытаться скопировать ключи, например, при помощи «Сервис – Скопировать контейнер» и, если вы получите ошибку «Ключ не может быть использован в указанном состоянии», это означает, что ключ запрещен для экспорта.