Если кому интересно, то как сказали в ЦЛЗ ФСБ, любые работы в рамках 313 постановления внутри и только для одного юридического лица (собственные нужды) не требуют лицензии.
Хотя если честно мне показалось, что они сами плавают в данных понятиях)

Strashila пишет:
я так думаю деятельность подпадает под "б) контроль защищенности конфиденциальной информации от несанкционированного доступа и ее модификации в средствах и системах информатизации…;"

Если мы говорим об удостоверяющем центре (УЦ), то УЦ осуществляет деятельность определенную Ст. 13 ФЗ «Об электронной подписи» и Ст. 9 ФЗ «Об электронной цифровой подписи». Связь деятельности УЦ с шифровальными средствами, средствами ЭП (ЭЦП) просматривается. Следовательно, получение лицензии ФСБ на криптографию очевидно и обязательно (ФЗ № 99-фз) а вот причем тут «контроль защищенности конфиденциальной информации от несанкционированного доступа и ее модификации в средствах и системах информатизации…», и где связь с деятельностью УЦ (Ст. 9 и 13)?

Касается. На ключевых носителях у вас хранятся ключевые документы. Ключевые документы относятся к СКЗИ.
Основание: пп.е) п.2 "Положения о лицензировании..." (утв. постановлением Правительства № 313-2012г.)

2. Разработка защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств информационных систем.
3. Разработка защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств телекоммуникационных систем.
7. Производство (тиражирование) шифровальных (криптографических) средств.
8. Производство защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств информационных систем.
9. Производство защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств телекоммуникационных систем.
11. Изготовление с использованием шифровальных (криптографических) средств изделий, предназначенных для подтверждения прав (полномочий) доступа к информации и (или) оборудованию в информационных и телекоммуникационных системах.
12. Монтаж, установка (инсталляция), наладка шифровальных (криптографических) средств.
13. Монтаж, установка (инсталляция), наладка защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств информационных систем.
14. Монтаж, установка (инсталляция), наладка защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств телекоммуникационных систем.
15. Монтаж, установка (инсталляция), наладка средств изготовления ключевых документов.
17. Ремонт, сервисное обслуживание защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств информационных систем.
18. Ремонт, сервисное обслуживание защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств телекоммуникационных систем.
19. Ремонт, сервисное обслуживание средств изготовления ключевых документов.
20. Работы по обслуживанию шифровальных (криптографических) средств, предусмотренные технической и эксплуатационной документацией на эти средства (за исключением случая, если указанные работы проводятся для обеспечения собственных нужд юридического лица или индивидуального предпринимателя).
21. Передача шифровальных (криптографических) средств.
22. Передача защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств информационных систем.
23. Передача защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств телекоммуникационных систем.
24. Передача средств изготовления ключевых документов.
25. Предоставление услуг по шифрованию информации, не содержащей сведений, составляющих государственную тайну, с использованием шифровальных (криптографических) средств в интересах юридических и физических лиц, а также индивидуальных предпринимателей.
26. Предоставление услуг по имитозащите информации, не содержащей сведений, составляющих государственную тайну, с использованием шифровальных (криптографических) средств в интересах юридических и физических лиц, а также индивидуальных предпринимателей.
27. Предоставление юридическим и физическим лицам защищенных с использованием шифровальных (криптографических) средств каналов связи для передачи информации.
28. Изготовление и распределение ключевых документов и (или) исходной ключевой информации для выработки ключевых документов с использованием аппаратных, программных и программно-аппаратных средств, систем и комплексов изготовления и распределения ключевых документов для шифровальных (криптографических) средств.
Моё мнение. Вы же не говорите конкретики. Вы сами разрабатываете ПО и в него внедряете СКЗИ, тогда пункты 2,3,8,9,27 (11 возможно в зависимости от ПО) к этому относятся. Если вы едите к клиенту ставите ПО + настраиваете, или они к вам приезжают, вы устанавливаете и настраиваете ПО у себя, то это пункты 12,13,14,15. если вы диски с СКЗИ копируете и продаете, то это пункт 7. Если дистрибутивы у поставщика покупаете и перепродаете без копий, значит этого пункта нет. 25,26,28 - по сути услуги УЦ.

СКЗИ вы сами поставляете или клиенты покупают непосредственно у производителя?