Позволю еще раз вернуться к цитате ст. 1473 ГК, а именно п.3. Юридическое лицо должно иметь полное фирменное наименование и вправе иметь сокращенное фирменное наименование. оба наименования фирменные. Заставить юрлицо указать именно полное наименование должны быть законные основания. А иначе юрлицо имеет право указать свое сокращенное фирменное наименование. При условии, что в Уставе указно сокращенное наименование наряду с полным наименованием.

в качестве фирменного (официального) заявитель имеет право указать как полное так и сокращенное. после изменений в методические указания можно будет требовать полное наименование. или следует получить разъяснения (письменного) от компитентного органа.

п.3 ст.1473 ГК РФ (см. цитату выше)

в настоящее время (при имеющемся тексте методических указаний) может быть указано полное и сокращенное наименование. Если будут (если они будут) изменения (требование указывать только полное намименование), тогда надо требовать тллько полное наименование.

Можно применять и те и другие, первые в АРМе ставить сложнее, поэтому ставим универсальные кавычки.
Проблемы с кавычками раньше были в СБИС (при сдаче отчетности). но разработчики это вроде исправили, давно с проблемами кавычек никто не обращался :)